mia-3dfluid - Online sa Cloud

Ito ang command mia-3dfluid na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator

PROGRAMA:

NAME


mia-3dfluid - Fluid dynamic na pagpaparehistro ng 3D

SINOPSIS


mia-3dfluid -i -r -o [mga pagpipilian]

DESCRIPTION


mia-3dfluid Ginagamit ang program na ito para sa hindi mahigpit na pagpaparehistro batay sa fluid dynamics bilang
inilarawan sa: Wollny, G. at Kruggel, F., 'Computational cost of non-rigid registration
mga algorithm batay sa fluid dynamics', IEEE Transactions on Medical Imaging, 11(8), pp.
946-952, 2002, doi:10.1109/TMI.2002.803113. Gumagamit ito ng SSD bilang tanging pagpaparehistro
pamantayan.

Opsyon


File-IO
-i --in-image=(input, kinakailangan); io
input image Para sa mga sinusuportahang uri ng file tingnan ang PLUGINS:3dimage/io

-r --ref-image=(input, kinakailangan); io
reference na larawan Para sa mga sinusuportahang uri ng file tingnan ang PLUGINS:3dimage/io

-o --out-transformation=(output, kinakailangan); io
pagbabagong-anyo ng output na binubuo ng field ng pagrerehistro ng pagbabagong-anyo Para sa
mga sinusuportahang uri ng file tingnan ang PLUGINS:3dtransform/io

-d --out-image=(output); io
save deformed image Para sa mga sinusuportahang uri ng file tingnan ang PLUGINS:3dimage/io

Tulong & Impormasyon
-V --verbose=babala
verbosity ng output, pag-print ng mga mensahe ng ibinigay na antas at mas mataas na priyoridad.
Ang mga sinusuportahang priyoridad na nagsisimula sa pinakamababang antas ay:
info - Mga mensahe sa mababang antas
kopyahin o sipiin sa pamamagitan ng pag-aninag - Trace ng tawag sa function
mabigo - Mag-ulat ng mga pagkabigo sa pagsubok
babala - Mga babala
mali - Mag-ulat ng mga error
mag-alis ng mga insekto ‐ Debug na output
mensahe - Mga normal na mensahe
nakamamatay ‐ Iulat lamang ang mga nakamamatay na pagkakamali

--copyright
i-print ang impormasyon sa copyright

-h --tulong
i-print ang tulong na ito

-? --gamit
mag-print ng maikling tulong

--bersyon
i-print ang numero ng bersyon at lumabas

Pagproseso
--mga thread=-1
Maximum na bilang ng mga thread na gagamitin para sa pagproseso, Ang bilang na ito ay dapat na mas mababa
o katumbas ng bilang ng mga lohikal na core ng processor sa makina. (-1:
awtomatikong pagtatantya). Pinakamataas na bilang ng mga thread na gagamitin para sa pagproseso, Ito
Ang numero ay dapat na mas mababa o katumbas ng bilang ng mga lohikal na core ng processor
ang makina. (-1: awtomatikong pagtatantya).

rehistrasyon parameter
--disable-multigrid
huwag paganahin ang multi-grid processing

--disable-fullres
huwag paganahin ang pagproseso sa buong resolution na imahe

--lambda=1
elasticy constantelasticy pare-pareho

--mu=1
elasticy constantelasticy pare-pareho

-s --start-size=16
paunang multigrided na laki paunang multigrided na laki

-m --paraan=sora
paraan para sa paglutas ng PDE
sugat ‐ sunud-sunod na overrelaxation
tunog - Gauss Southwell relexation

--step=0.8
Paunang hakbang-hakbangPaunang hakbang-hakbang

-p --interpolator=bspline:d=3
image interpolator kernelimage interpolator kernel Para sa mga sinusuportahang plugin
tingnan ang PLUGINS:1d/splinekernel

--relax=1
overrelaxation factor vor method soroverrelaxation factor vor method sor

--maxiter=10
maxium iterationsmaxium iterations

--epsilon=0.01
kondisyon ng putulantruncation condition

--bagay=4
intensity sa itaas kung saan ang tunay na bagay ay ipinapalagay (pang-eksperimentong) intensity sa itaas
aling tunay na bagay ang ipinapalagay (pang-eksperimento)

MGA PLUGIN: 1d/splinekernel


bspline B-spline kernel creation , ang mga sinusuportahang parameter ay:

d = 3; int sa [0, 5]
Spline degree.

omoms Ang paggawa ng kernel ng OMoms-spline, ang mga sinusuportahang parameter ay:

d = 3; int sa [3, 3]
Spline degree.

MGA PLUGIN: 3dimage/io


suriin Suriin ang 7.5 na larawan

Mga kinikilalang extension ng file: .HDR, .hdr

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
unsigned 8 bit, sign 16 bit, sign 32 bit, floating point 32 bit,
lumulutang na punto 64 bit

datapool Virtual IO papunta at mula sa panloob na data pool

Mga kinikilalang extension ng file: .@

dicom Mga serye ng imahe ng Dicom bilang 3D

Mga kinikilalang extension ng file: .DCM, .dcm

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 16 bit, hindi nilagdaan ang 16 bit

hdf5 HDF5 3D na imahe IO

Mga kinikilalang extension ng file: .H5, .h5

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, 8 bit na nilagdaan, 8 bit na hindi nilagdaan, 16 bit na nilagdaan, 16 bit na hindi nilagdaan,
nilagdaan ang 32 bit, hindi nalagdaan 32 bit, nilagdaan ang 64 bit, hindi nalagdaan 64 bit, lumulutang
point 32 bit, floating point 64 bit

inria Larawan ng INRIA

Mga kinikilalang extension ng file: .INR, .inr

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 8 bit, hindi nilagdaan ang 8 bit, nilagdaan ng 16 bit, hindi nalagdaan ng 16 bit, nilagdaan ng 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit

mhd MetaIO 3D image IO gamit ang pagpapatupad ng VTK (pang-eksperimento).

Mga kinikilalang extension ng file: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 8 bit, hindi nilagdaan ang 8 bit, nilagdaan ng 16 bit, hindi nalagdaan ng 16 bit, nilagdaan ng 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit

nifti NIFTI-1 3D na imahe IO

Mga kinikilalang extension ng file: .NII, .nii

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 8 bit, hindi nilagdaan ang 8 bit, nilagdaan ng 16 bit, hindi nalagdaan ng 16 bit, nilagdaan ng 32
bit, unsigned 32 bit, signed 64 bit, unsigned 64 bit, floating point 32
bit, lumulutang na punto 64 bit

vff VFF Sun raster na format

Mga kinikilalang extension ng file: .VFF, .vff

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
unsigned 8 bit, sign 16 bit

tingnan 3D view

Mga kinikilalang extension ng file: .V, .VISTA, .v, .vista

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, 8 bit na nilagdaan, 8 bit na hindi nilagdaan, 16 bit na nilagdaan, 16 bit na hindi nilagdaan,
nilagdaan ang 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
kaunti

VTI 3D na larawang VTK-XML sa- at output (pang-eksperimento).

Mga kinikilalang extension ng file: .VTI, .vti

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 8 bit, hindi nilagdaan ang 8 bit, nilagdaan ng 16 bit, hindi nalagdaan ng 16 bit, nilagdaan ng 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit

vtk 3D VTK image legacy sa- at output (pang-eksperimento).

Mga kinikilalang extension ng file: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, 8 bit na nilagdaan, 8 bit na hindi nilagdaan, 16 bit na nilagdaan, 16 bit na hindi nilagdaan,
nilagdaan ang 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
kaunti

MGA PLUGIN: 3dtransform/io


bbs Binary (non-portable) serialized IO ng 3D transformations

Mga kinikilalang extension ng file: .bbs

datapool Virtual IO papunta at mula sa panloob na data pool

Mga kinikilalang extension ng file: .@

tingnan Vista storage ng mga 3D transformation

Mga kinikilalang extension ng file: .v, .v3dt

xml XML serialized IO ng 3D transformations

Mga kinikilalang extension ng file: .x3dt

Halimbawa


Irehistro ang image test.v sa image ref.v at isulat ang deformation vector field regfield.v.
Simulan ang pagpaparehistro sa pinakamaliit na sukat sa itaas ng 16 pixel.

mia-3dfluid -i test.v -r ref.v -o regfield.v -s 16

AUTHOR(s)


Gert Wollny

COPYRIGHT


Ang software na ito ay Copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Germany at Madrid, Spain. Dumating ito
na WALANG WARRANTY at maaari mo itong muling ipamahagi sa ilalim ng mga tuntunin ng GNU
PANGKALAHATANG PUBLIC LICENSE Bersyon 3 (o mas bago). Para sa karagdagang impormasyon, patakbuhin ang programa gamit ang
opsyon na '--copyright'.

Gumamit ng mia-3dfluid online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net



Pinakabagong Linux at Windows online na mga programa