Ito ang command positionDB na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
positionDB - pamamahala ng mga posDB file
SINOPSIS
positionDB [-mersize k] [-merskip k] [-paggamit a-b,c] [-merbegin b] [-merend e] -pagkakasunod-sunod
s.fasta -output p.posDB
positionDB -tapon datafile
positionDB -pagsusulit1 sequence.fasta
positionDB -pagsusulit2 db.fasta sequence.fasta
Opsyon
gusali an larawan
-mersize k
Ang laki ng mers, default=20.
-merskip k
Ang paglaktaw sa pagitan ng mga mers, default=0
-paggamit a-b,c
Tukuyin kung aling mga sequence ang gagamitin, default=all
-merbegin b
Bumuo sa isang subset ng mers, simula sa mer #b, default=all mers
-merend e
Bumuo sa isang subset ng mers, na nagtatapos sa mer #e, default=all mers
-pagkakasunod-sunod s.fasta
Mga pagkakasunud-sunod ng input.
-output p.posDB
Pangalan ng file output.
Paglalaglag impormasyon tungkol sa an larawan
-tapon datafile.posDB
Tumatakbo kalinisan pagsusulit
-pagsusulit1 sequence.fasta
Sinusuri kung ang bawat mer ay matatagpuan sa positionDB. Mag-ulat kung hindi ito mahanap
a mer sa tamang posisyon. Hindi nag-uulat kung ang talahanayan ay may masyadong maraming bagay.
-pagsusulit2 db.fasta sequence.fasta
Bumubuo ng a positionDB mula db.fasta, pagkatapos ay hahanapin ang talahanayan para sa bawat mer in
sequence.fasta. Iniuulat ang lahat ng mer na nahanap nito.
Ito ay isang hangal na pagsubok at hindi mo dapat gawin ito.
Gamitin ang positionDB online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net