Ito ang simpleng command na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
simple - ang halatang array-based na kmer counter
SINOPSIS
simple [-f|-r|-C] [-c pagpiga] [-m mersize] -i input -o output
DESCRIPTION
simple ay isang napakasimpleng mer counter. Naglalaan ito ng napakalaking 32-bit na hanay, pinaninirahan ang
array na may mers, nag-uuri, at nagsusulat ng output. Maglalaan ito ng 4 na byte bawat kmer. k=16
mangangailangan ng 16 GB upang tumakbo.
Opsyon
-i input
-o output
-m mersize
ang laki pa. Ang default ay 22
-f forward kmer (ito ang default)
-r baligtarin kmer
-C canonical kmer (lexicographically mas maliit ng forward at reverse kmer sa bawat isa
lokasyon)
-c # mer compression
Gumamit ng simpleng online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net