Ito ang Linux app na pinangalanang CTK na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang Version1.1.5sourcecode.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang CTK na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA SCREENSHOT:
CTK
DESCRIPTION:
Ang CTK (CLIP Tool Kit) ay isang computational biology toolkit na ipinatupad sa Perl, na idinisenyo para sa pagsusuri ng CLIP sequencing data. Nag-aalok ito ng naka-streamline na pipeline mula sa mga raw reads sa pamamagitan ng peak calling at motif discovery.
Mga tampok
- Pinag-parse ang hilaw na CLIP-seq na nagbabasa at nagsasagawa ng de-kalidad na pag-filter
- Kinikilala ang cross-linking induced mutation sites (CIMS)
- Natutukoy ang mga rehiyon at mga peak na may enriched na motif ng RNA
- Naglalabas ng mga standardized na format ng BED/narrowPeak
- Napapalawak sa pamamagitan ng mga script ng Perl (hal. tag2cluster, tag2collapse)
- Komprehensibong dokumentasyon at aktibong pangkat ng suporta ng user
Wika ng Programming
Perl
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/ctk.mirror/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.