Ito ang Linux app na pinangalanang locusvu na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang LocusVu.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang locusvu para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA SCREENSHOT:
locusvu upang tumakbo sa Linux online
DESCRIPTION:
Ang LocusVu ay isang nobelang Java based software tool na tumatanggap ng isang listahan ng genomic loci (mga posisyon sa chromosome) bilang input at awtomatiko ang pagkuha ng mga nauugnay na impormasyon (cytogenetic band, gene name, OMIM data atbp.) mula sa mga pampublikong database gaya ng UCSC genome browser database. Pagkatapos ay pinapagana nito ang maraming daloy ng trabaho sa mga nakuhang resulta, tulad ng paghahambing ng maraming dataset (comparative genomics), pagtingin sa mga kalapit na gene para sa isang loci mula sa loob mismo ng tool, o graphic na kumakatawan sa mga resultang ito sa mga bar / pie chart. Ang LocusVu ay may simpleng madaling gamitin na GUI sa frontend na nagbibigay-daan sa intuitive na pakikipag-ugnayan ng user sa pinagbabatayan na lohika.Ang tool ay madaling mapalawak upang magdagdag ng suporta para sa iba pang mga database (hal. Ensembl) o upang makakuha ng impormasyon
mula sa iba pang mga talahanayan sa database. Kaya, ang LocusVu ay nagbibigay ng pangunahing balangkas na maaaring magamit ng mga user at developer sa pagpapasimple ng mga kasalukuyang daloy ng trabaho at paglikha ng mga mas bago upang suportahan ang pagsusuri ng data sa genomics.
Mga tampok
- Nag-automate ng pagkuha ng data mula sa mga database (kasalukuyang UCSC genome browser database)
- Pinapagana ang mga daloy ng trabaho sa mga nakuhang resulta tulad ng..
- ..paghahambing ng maraming dataset (comparative genomics)
- ..tingnan ang mga kalapit na gene para sa isang locus (mula sa mismong tool)
- ..graphical na kumakatawan sa mga resulta (bar / pie chart)
- Madaling gamitin na GUI sa frontend para sa intuitive na paggamit
- Pag-log gamit ang Log4j para sa madaling pag-debug
- Madaling mapalawak
Audience
Agham/Pananaliksik, Mga Nag-develop
Interface ng gumagamit
Java Swing
Wika ng Programming
Java
Kapaligiran ng Database
MySQL
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/locusvu/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.