Ito ang Linux app na pinangalanang NeedlemanWunsch na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang needleman_wunsch-0.3.5.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang NeedlemanWunsch sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA SCREENSHOT:
NeedlemanWunsch
DESCRIPTION:
NILIPAT SA GITHUB: https://github.com/noporpoise/seq-align
Global optimal sequence alignment gamit ang Needleman-Wunsch algorithm.
Inihanay ang DNA, RNA, pagkakasunud-sunod ng protina at higit pa!
Tingnan ang lokal na pagkakahanay ng aming kapatid na proyekto gamit ang Smith-Waterman:
http://sourceforge.net/projects/smithwaterman/
Mga tampok
- Affine gap penalties
- Maaaring magtakda ng walang gap penalty para sa mga gaps sa simula at dulo ng mga alignment
- May kulay na ouput
- Nagbabasa ng FASTA, FASTQ at mga plain sequence na file (inc. gzip'ed na mga file)
- Preset na DNA/Protein substitution matrice (PAM/BLOSUM atbp)
- Maaaring mag-load ng substitution penalty matrice
- Portable C code na maaaring magamit sa ibang mga proyekto ng bioinformatics
Audience
Agham/Pananaliksik, Edukasyon
Interface ng gumagamit
Console/Terminal, Command-line
Wika ng Programming
C++, C
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/needlemanwunsch/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.