Ito ang Linux app na pinangalanang Pysimony na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang Pysimony.py. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Pysimony para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
Pysimony na tumakbo sa Linux online
DESCRIPTION:
I-UPDATE: Pagkatapos ng ilang pag-aayos ng bug, tinanggal ko ang Pysimony para sa Javamony: https://sourceforge.net/projects/javamony/Dahil sa kagandahan ni Python, alam kong balang araw ay kailangan kong tapusin ang Pysimony.
Ang unang pagtatangka ng isang mag-aaral sa isang phylogenetic inference program, na nakasulat sa simple ngunit eleganteng Python.
Nagbabasa si Pysimony ng FASTA file (ATGC lang ang tinanggap) na tinukoy bilang ang tanging argumento nito. Ang pangunahing pagsusuri ay nagpakita na ito ay mabagal, hindi tumpak at pinaka-tiyak na hindi epektibo. Ang isang hindi malamang na-na-the-most-parsimonious tree ay naka-print kapag nakumpleto sa pangunahing format ng Newick tree.
Dahil ang lahat ng bahagi ng programa ay orihinal na gawain ng isang baguhan na programmer, ito ay maaaring kumakatawan sa isa sa mga pinakamasamang paraan sa paglutas ng phylogenetic na problema. Malinaw kong iniiwasan ang object-oriented programming.
Gayunpaman, ipinamahagi ko ang pag-iisip na ito ay maaaring balang araw ay bahagyang pang-edukasyon o hindi bababa sa pagtawa sa kalunus-lunos na pagtatangka na ginagawa nitong muling likhain ang gulong
Mga tampok
- Maling parsimony calculator
- Nagbabasa ng mga file ng FASTA (ATGC lang)
- Outputs tree sa Newick format
- Simple, single mode
Audience
Agham/Pananaliksik, Edukasyon
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Sawa
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/pysimony/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.