Ito ang Linux app na pinangalanang QUASR na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang QUASR_v6.08.tar. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang QUASR sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA SCREENSHOT:
QUASR
DESCRIPTION:
Ang QUASR ay isang magaan na pipeline na isinulat upang iproseso at suriin ang data ng next-generation sequencing (NGS) mula sa mga platform ng Illumina, 454, at Ion Torrent. Bagama't orihinal na isinulat para sa viral data, ito ay sapat na generic upang gumana sa anumang NGS dataset. Kasama sa mga function ang:
dobleng pag-alis
demultiplexing
panimulang-pagtanggal
quality-assurance (QA) graphing
kontrol sa kalidad (QC)
consensus-generation
minorya-variant na pagpapasiya
minority-variant graphing
Ang pangunahing kasalukuyang bersyon ay 6.X, na nakasulat sa Python3. Ang 7.X ay ang aking muling pagsulat sa Java, ngunit gumagana pa rin. Parehong isinulat upang maging magaan hangga't maaari upang maaari silang tumakbo nang may kaunting memory-requirements sa isang desktop o laptop pati na rin sa isang compute cluster.
Kung mayroon kang anumang mga problema sa QUASR, mangyaring makipag-ugnayan sa akin sa email address na ibinigay sa README.
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Sawa
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/quasr/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.