Ito ang Linux app na pinangalanang RGAAT na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang RGAAT.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang RGAAT sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA SCREENSHOT:
RGAAT
DESCRIPTION:
Ang program na ito ay maaaring mag-assemble at/o mag-annotate ng genome para sa bagong genome at kilalang genome upgrade gamit ang sequence alignment file (SAM o BAM format), sequence variant file (VCF format o five coloum table (tab-delimited, kabilang ang chromosome, position, id, reference allele at alternatibong allele)) o bagong genome sequence file (FASTA format) batay sa reference na genome sequence file (FASTA format) at annotation file (TBL, GTF, GFF, GFF3 o BED na format).
Mga tampok
- pagkakakilanlan ng pagkakaiba-iba ng pagkakasunud-sunod
- pagbuo ng pagkakasunud-sunod ng genome consensus
- pagbabago ng genome
- paghahambing ng genome
- genome annotation
- pagbuo ng genome coordinate conversion sa pagitan ng iba't ibang bersyon ng genome assembly
Audience
Agham/Pananaliksik
Wika ng Programming
Perl
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/rgaat/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.