Ito ang Windows app na pinangalanang clusterProfiler na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang clusterProfilersourcecode.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang clusterProfiler na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
MGA SCREENSHOT:
clusterProfiler
DESCRIPTION:
Ang clusterProfiler ay isang R/Bioconductor package na nagbibigay ng pinag-isang daloy ng trabaho para sa functional enrichment analysis upang bigyang-kahulugan ang mga resulta ng high-throughput omics. Sinusuportahan nito ang parehong over-representation analysis at gene set enrichment analysis, na hinahayaan kang magtrabaho kasama ang mga walang ranggo na listahan ng gene o ranggo na istatistika mula sa differential pipelines. Kumokonekta ang package sa maraming base ng kaalaman—gaya ng Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH at iba pa—sa pamamagitan ng pare-parehong interface para makapag-query ka ng iba't ibang biological lens nang walang muling pagsusulat ng code. Ito ay dinisenyo para sa lawak, sumasaklaw sa coding at non-coding na mga tampok at libu-libong mga organismo sa pamamagitan ng paggamit ng patuloy na na-update na mga anotasyon. Ibinabalik ang mga resulta sa maayos, manipulation-friendly na mga istruktura at natural na ipares sa mga rich visualization function (sa pamamagitan ng companion tooling) upang ibuod ang mga pathway, termino, at gene-set na relasyon.
Mga tampok
- Pinag-isang ORA at GSEA ang mga daloy ng trabaho sa maraming pinagmulan ng anotasyon
- Suporta ang malawak na species gamit ang napapanahon na mga anotasyon ng gene
- Malinis na mga output na malinis na pinagsama sa mga downstream na R data pipeline
- Built-in na visualization ng mga resulta ng pagpapayaman sa pamamagitan ng kasamang mga tool sa pag-plot
- Mga kagamitan sa paghahambing ng maraming pangkat (hal., compareCluster) para sa pagsusuri ng cross-condition
- Mga detalyadong vignette at manual para sa mga reproducible, end-to-end na pag-aaral sa pagpapayaman
Wika ng Programming
R
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.