Ito ang Windows app na pinangalanang NOFI ranking na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang NOFI-ranking_v1.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang NOFI ranking sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
ranggo ng NOFI
DESCRIPTION:
Ang NOFI ranking algorithm ay binuo upang magtalaga ng mababang priyoridad sa mga fragment ions na apektado ng interference. Ang pagpapatupad ay isang R script na maaaring i-customize. Ang isang bersyon sa hinaharap ay maglalaman ng isang modular na bersyon. Ang balangkas ay ang mga sumusunod:
1) Ang input ay naglalaman ng listahan ng mga SWATH fragment ion XIC mula sa natukoy at na-quantified na mga peptide ng software tool gaya ng Skyline at OpenSWATH.
2) Ang unang hakbang sa NOFI ay ang pag-compute ng 4 na katangian (RTd, FWHMd, IRd at IRrep) na ginamit upang kumatawan sa bawat fragment ion bilang isang vector.
3) Ginagamit ang mga multivariate na outlier detection technique para i-rank ang lahat ng fragment ions mula sa bawat peptide.
4) Maraming figure ang nabuo (isang pdf file) upang mailarawan ang epekto ng Top-N fragment ions sa iba't ibang indicator.
5) Maaaring piliin ng user ang bilang ng mga nangungunang fragment ions bawat peptide, sa gayon ay ginagamit ang pinakamainam na subset ng mataas na priyoridad na Top-N NOFI para sa quantification habang hindi kasama ang mga may kapansanan na fragment ions.
Audience
Agham/Pananaliksik
Wika ng Programming
S / R
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/nofiranking/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.