Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen bowtie2-inspect komutudur.
Program:
ADI
bowtie2-inspect - bowtie2-inspect-* dizini için sarıcı
SİNOPSİS
papyon2-inspect [seçenekleri]*
TANIM
Bowtie 2 sürüm 2.2.6, Ben Langmead tarafından (langmea@cs.jhu.edu, www.cs.jhu.edu/~langmea)
bt2 dosya adı eksi .1.bt2/.2.bt2
Varsayılan olarak, indekslenmiş nükleotid dizilerinin FASTA kayıtlarını standart olarak yazdırır.
dışarı. İle birlikte -n, sadece isimleri yazdırır. İle birlikte -s, sadece dizinin bir özetini yazdırır
parametreler ve diziler. İle birlikte -e, varsa renkleri korur.
SEÇENEKLER
--büyük-indeks
'küçük' bir endeks mevcut olsa bile 'büyük' endeksin zorla denetlenmesi.
-a/--karşısında
FASTA çıkışındaki karakter sayısı (varsayılan: 60)
-n/--isimler
Yalnızca referans dizisi adlarını yazdır
-s/--Özet
Baskı özeti dahil. başvuru adları, uzunluklar, dizin özellikleri
-e/--bt2-ref
.bt2'den referansı yeniden oluşturun (yavaş, renkleri korur)
-v/--ayrıntılı
Ayrıntılı çıktı (hata ayıklama için)
-h/--Yardım
aracın ayrıntılı açıklamasını ve seçeneklerini yazdırın
--yardım et bu kullanım mesajını yazdır
onworks.net hizmetlerini kullanarak bowtie2-inspect'i çevrimiçi kullanın