Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen bp_run_protdist.plp komutudur.
Program:
ADI
run_neighbor - Phylip'in 'protdist' programını Bioperl aracılığıyla çalıştır
SİNOPSİS
run_protdist [-i girdi dosyası] [-o çıkış dosyası adı]
TANIM
Protdist'i çalıştırmak için bir hizalama dosyası sağlayın. Dosya .aln veya .phy olarak adlandırılmalıdır.
Bu, bir küme hizalamasını dönüştürmemiz gerekip gerekmediğini belirleyebilmemiz için gereklidir.
filip. Betiği, bioperl olan diğer MSA formatları üzerinde çalışacak şekilde genişletebilirsiniz.
destekler. Bu, çok basit manuel boru hatlarında kullanılmak üzere tasarlanmıştır.
Girdi dosyası file.phy veya file.aln biçiminde adlandırılmalıdır.
(\S+)\.(\S+) biçiminde dosya.
Bu, aa proteini oluşturmak için 'KIMURA' formülünü kullanarak 'protdist' uygulamasını çalıştıracaktır.
mesafe matrisi. phylip3.6'ya sahip olanlar, kullanmak isterlerse bazı değişiklikler yapmak isteyeceklerdir.
JTT. İstenirse, bunu bir cmd satırı argümanı olarak eklemekten memnuniyet duyarım.
onworks.net hizmetlerini kullanarak bp_run_protdist.plp'yi çevrimiçi kullanın