Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen fdnadiste komutudur.
Program:
ADI
fdnadist - Nükleik asit dizisi Distance Matrix programı
SİNOPSİS
fdnadist -sıra sıralı setall -yöntem liste -gama liste -kategoriler tamsayı -oranı dizi
-kategoriler özellikleri [ağırlıklar özellikleri] -gama katsayısı şamandıra
-invarfrac şamandıra -tratio şamandıra -freqs from geçiş -temel frekans dizi
[-alt boole] [-insan tarafından okunabilir boole] -outfile dış dosya [-baskı verileri boole]
[-ilerlemek boole]
fdnadist -Yardım
TANIM
fdnadist EMBOSS'un (“Avrupa Moleküler Biyoloji Açık
Yazılım Paketi”). "Filojeni:Moleküler dizi" komut grup(lar)ının bir parçasıdır.
SEÇENEKLER
Giriş Bölüm
-sıra sıralı setall
Bir veya daha fazla dizi hizalaması içeren dosya
-yöntem liste
Varsayılan değer: F84 mesafe modeli
-gama liste
Varsayılan değer: Kullanılan dağıtım parametresi yok
-kategoriler tamsayı
Varsayılan değer: 1
-oranı dizi
Varsayılan değer: 1.0
-kategoriler özellikleri
İkame oranı kategorileri dosyası
ağırlıklar özellikleri
Ek Bölüm
-gama katsayısı şamandıra
Varsayılan değer: 1
-invarfrac şamandıra
Varsayılan değer: 0.0
-tratio şamandıra
Varsayılan değer: 2.0
-freqs from geçiş
Varsayılan değer: Y
-temel frekans dizi
Varsayılan değer: 0.25 0.25 0.25 0.25
-alt boole
Varsayılan değer: N
-insan tarafından okunabilir boole
Varsayılan değer: @($(method)==s?Y:N)
Çıktı Bölüm
-outfile dış dosya
-baskı verileri boole
Varsayılan değer: N
-ilerlemek boole
Varsayılan değer: Y
onworks.net hizmetlerini kullanarak fdnadiste çevrimiçi kullanın