Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi öykünücüsü veya MAC OS çevrimiçi öykünücüsü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut boşluğu5'tir.
Program:
ADI
gap5 - Genom Birleştirme Programı (staden paketinin bir parçası)
SİNOPSİS
gap5 [-ro] [-maxseq ] [-maxdb ] [-skip_notes] [DATABASE_NAME.V]
TANIM
Gap5 bir Genom Derleme Programıdır. Program, olabilecek tüm araçları içerir.
Bir montaj programından beklenen artı birçok benzersiz özellik ve çok kolay kullanılan
arayüz. Orijinal versiyon Bonfield,JK, Smith,KF ve Staden,R. A
yeni DNA dizisi birleştirme programı. Nükleik Asitler Araş. 24, 4992-4999 (1995)
Gap5 çok büyük ve güçlü. Herkes bir seçenekler alt kümesi kullanır ve kendi
bunlara erişmenin ve bunları kullanmanın favori yolu. Birçoğu olmasına rağmen, kullanıcılar
ne olduğunu keşfetmek için belgelerin tamamını bir kez gözden geçirmeye teşvik edildi.
mümkün ve kendi çalışmalarına en uygun şekilde. En azından bütün bunlar
giriş bölümü okunmalı, uzun vadede olduğu gibi zaman kazandıracaktır.
SEÇENEKLER
-ro Salt okunur
-maxseq N
İlk maksimum toplam fikir birliği uzunluğu
-maxdb N
İlk maksimum contig sayısı + okumalar
-(kontrol yok
(Yapmayın) DB açıkken Veritabanını Kontrol Et'i çalıştırın
-(no_)exec_notes
(Yapmayın) veritabanı açıldığında OPEN/CLOS notlarını yürütün
-(no_)rawdata_note
(Yapmayın) RAWDATA env yerine RAWD notu kullanın. değişken
-(hayır_)csel
(Yapmayın) db açıkken contig seçiciyi başlatın
-Görüntüle
X Ekranı kullanmak
-bit boyutu N
Yeni veritabanları için aux dosyası bit boyutunu belirtir (32/64)
-senkronizasyon Görüntü sunucusu için eşzamanlı modu kullan (hata ayıklama)
-- Argüman listesinin sonu
onworks.net hizmetlerini kullanarak gap5'i çevrimiçi kullanın