Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi öykünücüsü veya MAC OS çevrimiçi öykünücüsü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen ltrsift komutudur.
Program:
ADI
ltrsift - LTR'nin sonradan işlenmesi ve sınıflandırılması için bir grafik arayüz
retrotranspozon adayları
SİNOPSİS
ltr eleme
TANIM
LTRsift, tahmin edilen de novo'nun yarı otomatik son işlemesi için bir grafik masaüstü aracıdır.
LTRharvest ve LTRdigest tarafından oluşturulanlar gibi LTR retrotranspozon ek açıklamaları.
YAPILANDIRMA
LAST ikili dosyaları (lastal ve lastdb) sistem arama yolunda bulunmalıdır. Eğer onlar
değil, "GT_LAST_PATH" ortamını kullanarak konumlarını belirtmek mümkün mü?
LTRsift'i çalıştırmadan önce değişken. Aynısı BLAST konumu için de geçerlidir. Kullanmak
"blastall" yürütülebilir dosyasının tam yolunu belirtmek için "GT_BLAST_PATH".
Stil dosyaları (aday özelliklerin lineer diyagramının nasıl göründüğünü açıklayan) şu şekilde olabilir:
LTRSIFT_STYLE_FILE ortam değişkeni aracılığıyla ayarlanır. Mantıklı bir varsayılan stil oluşturuldu
LTRsift'e girin.
onworks.net hizmetlerini kullanarak ltrsift'i çevrimiçi kullanın