Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen xplor2gmx komutudur.
Program:
ADI
xplor2gmx - XPLOR mesafe sınırlamalarını Gromacs formatına dönüştürün
SİNOPSİS
xplor2gmx (kalıntı telafi etmek) giriş.pdb
TANIM
xplor2gmx bazen bulunduğu gibi mesafe kısıtlama verileriyle bir XPLOR girdi dosyasını okur
pdb veritabanı (http://www.pdb.org). Bu girdi dosyasından dihedral kısıtlamalar olmalıdır
kaldırılır, öyle ki sadece mesafe sınırlamaları kalır. Komut belirsiz işleyebilir
kısıtlamalar. Mesafe sınırlamalarını GROMACS formatına dönüştürür.
STDIN'de bir kısıtlama dosyası (.dat) sağlanmalıdır ve uygun bir çıktı dosyası (.itp)
STDOUT'a gönderildi.
ÖRNEKLER
xplor2gmx.pl 33 conf.pdb < kısıtlamalar.dat > disre.itp
SEÇENEKLER
xplor2gmx iki komut satırı seçeneği gerektirir: ilki, kalıntı ofseti (tamsayı); ikinci,
.pdb dosya adı. pdb dosyası doğru atom numaralarına sahip olmalıdır.
onworks.net hizmetlerini kullanarak xplor2gmx'i çevrimiçi kullanın