Bu, en son sürümü ARDEN.zip olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalışacak ARDEN adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için ARDEN adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
ARDEN çevrimiçi olarak Linux'ta çalışacak
AÇIKLAMA:
Gerçek deneysel okumalara ve ek olarak oluşturulmuş bir yapay referans genomuna dayalı hata oranlarını tahmin eden yeni bir kıyaslama olan ARDEN'i (NGS verilerinde yanlış pozitiflerin Yapay Referansa Dayalı Tahmini) sunuyoruz. Özellikle bir veri kümesi için hata oranlarının hesaplanmasına ve bir ROC eğrisinin oluşturulmasına izin verir. Böylece, okuma eşleyicileri için parametreleri optimize etmek, belirli bir problem için okuma eşleyicileri seçmek veya kalite tahminine dayalı hizalamaları filtrelemek için kullanılabilir.Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
Python
Bu, https://sourceforge.net/projects/arden/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.