Bu, en son sürümü Runningexample.zip olarak indirilebilen CaptureProbe adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
CaptureProbe adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
Yakalama Sondası
AÇIKLAMA:
Burada, Capture Hi-C uygulamaları için yakalama probları tasarlamak için kullanıcı dostu ve grafiksel bir Java aracı olan CaptureProbe'u geliştirdik. CaptureProbe'un kullanımı kolaydır, yalnızca basit girdi dosyalarına ihtiyaç duyar ve prob tasarlamak için bol miktarda parametre sağlar. CaptureProbe, hem genomik siteler hem de ilgili genomik bölgeler için özel olarak problar tasarlayabilir. Mevcut yazılımlarla (HiCapTools ve GOPHER) karşılaştırmalar, CaptureProbe'un iyi bir tasarım başarı oranına ve daha iyi prob özgüllüğüne sahip olduğunu göstermiştir.
Alıntı: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020. CaptureProbe: Hi-C uygulamalarını yakalamak için problar tasarlamaya yönelik bir java aracı. Zool Res [J], 41: 94-96.
Bu, https://sourceforge.net/projects/captureprobe/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.