Bu, en son sürümü ForceGenV0.4.jar olarak indirilebilen ForceGen adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
ForceGen adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN GÖRÜNTÜLERİ:
KuvvetGen
AÇIKLAMA:
Lütfen alıntı yapın:ForceGen: Gromac'lar için atomik kovalent bağ sabiti türevi. Nash A, Collier T, Birch HL, de Leeuw NH. Moleküler Modelleme Dergisi (2018), (24)5. DOI: 10.1007/s00894-017-3530-6
Talimat videosu:
https://youtu.be/fQVXv8Ge_tg
Bu Java yürütülebilir kavanozu, kuantum mekanik Gauss hesaplamalarından bağ gerilmesi ve bağ açısı için ikinci dereceden bağ kuvveti sabitlerini türetir. Hesaplamalar, Amber kuvvet alanı ailesi veya moleküler parçalardan Hessian'ın ikinci derece tensöründen türetilen herhangi bir kuvvet alanı ile uyumludur. Çıktı, Gromacs topoloji formatı ile uyumlu hale getirilmiştir.
Kullanım örnekleri, aşağıdakiler için bağ kuvveti sabitlerinin ve denge değerlerinin türetilmesini içerir:
Protein aktif bölgelerinde bağlı metaller
-değiştirilmiş amino asitler
-küçük moleküller/ilaç molekülleri
Örnek dosyalardan oluşan bir zip dosyası, "Tüm Dosyalara Göz At" bağlantısını takip ederek bulunabilir.
Dr Anthony Nash (Oxford) tarafından yazıldı.
Dr Thomas Collier, Prof Helen Birch ve
Özellikler
- Bağ gerdirme kuvveti sabit türevi
- Bağ açısı kuvveti sabit türevi
- Gromacs topolojisi ile uyumluluk
Bu, https://sourceforge.net/projects/forcegen/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.