Bu, en son sürümü SSRs.zip olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalışacak iMSAT adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için iMSAT adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN GÖRÜNTÜLERİ:
iMSAT, Linux'ta çevrimiçi çalışacak
AÇIKLAMA:
iMSAT, vcf2MSAT programının tam güncellemesini temsil eder. Bu komut satırı python programı, bir kullanıcının polimorfik mikro uydu işaretleyicilerini (MSAT'ler veya STR'ler) aramak için SAM ve BAM araçları kullanılarak oluşturulan polimorfizm verilerini ve bir .fasta hizalama dosyasını kullanmasına olanak tanır. iMSAT, önceki programların yaptığı gibi basit tekrar bölgeleri yerine polimorfik oluşturucuları belirleyerek, polimorfik MSAT'lerin tanımlanma hızını büyük ölçüde artırır ve araştırmacıların değerli zaman ve paradan tasarruf etmesini sağlar. Ziyaret http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/858/abstract iMSAT'ın faydasını açıklayan pdf makalesi için ve programı kullanıyorsanız lütfen bu makaleyi şu şekilde alıntılayın: Andersen ve Mills: iMSAT: barkodlu Illumina kitaplıklarını kullanarak mikro uydu lokuslarının geliştirilmesine yeni bir yaklaşım. BMC Genomik 2014 15:858.Özellikler
- Polimorfik Mikrouydu Tanımlama
- Illumina Sıralaması
- Genomik Analiz
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
Python
Bu, https://sourceforge.net/projects/imsat/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.