Bu, en son sürümü ProGraphMSA-20130709.tar.gz olarak indirilebilen ProGraphMSA adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
ProGraphMSA adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
ProGraphMSA
AÇIKLAMA:
ProGraphMSA, kılavuz ağacın dallanma modelinde alternatif eklemelere ve hatalara izin vererek sağlamlığı korurken filogenetik olarak duyarlı boşluk kalıpları üreten son teknoloji ürünü bir çoklu dizi hizalama aracıdır. Bu, POA'da olduğu gibi grafik tabanlı bir dizi gösterimi dahil edilerek elde edilir ve bunu Prank'teki filogeniye duyarlı algoritmanın avantajlarıyla birleştirir. Ayrıca, tahmini amino asit frekanslarını kullanarak ve CS-Blast'ta olduğu gibi bağlama özel profiller uygulayarak ikame modelindeki varyasyonları hesaba katarız.ProGraphMSA'nın en son sürümleri, tandem tekrarlı birim ekleme ve silme işlemlerini desteklemek için hizalama modelini içerir ve bu modelin uzantısını içerir.
Bu, https://sourceforge.net/projects/prographmsa/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.