This is the Windows app named clusterProfiler whose latest release can be downloaded as clusterProfilersourcecode.tar.gz. It can be run online in the free hosting provider OnWorks for workstations.
Download and run online this app named clusterProfiler with OnWorks for free.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden herhangi bir OS OnWorks çevrimiçi öykünücüsünü başlatın, ancak daha iyi Windows çevrimiçi öykünücüsü.
- 5. Yeni başlattığınız OnWorks Windows işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin ve kurun.
- 7. Wine'ı Linux dağıtımları yazılım havuzlarınızdan indirin. Kurulduktan sonra, Wine ile çalıştırmak için uygulamaya çift tıklayabilirsiniz. Ayrıca, popüler Windows programlarını ve oyunlarını yüklemenize yardımcı olacak Wine üzerinden gösterişli bir arayüz olan PlayOnLinux'u da deneyebilirsiniz.
Wine, Windows yazılımını Linux üzerinde çalıştırmanın bir yoludur, ancak Windows gerektirmez. Wine, Windows programlarını doğrudan herhangi bir Linux masaüstünde çalıştırabilen açık kaynaklı bir Windows uyumluluk katmanıdır. Esasen Wine, Windows'a ihtiyaç duymadan tüm bu Windows uygulamalarını çalıştırabilmesi için yeterince Windows'u sıfırdan yeniden uygulamaya çalışıyor.
EKRAN GÖRÜNTÜLERİ:
kümeProfiler
AÇIKLAMA:
clusterProfiler is an R/Bioconductor package that provides a unified workflow for functional enrichment analysis to interpret high-throughput omics results. It supports both over-representation analysis and gene set enrichment analysis, letting you work with unranked gene lists or ranked statistics from differential pipelines. The package connects to multiple knowledge bases—such as Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH and others—through a consistent interface so you can query different biological lenses without rewriting code. It is designed for breadth, covering coding and non-coding features and thousands of organisms by leveraging continuously updated annotations. Results are returned in tidy, manipulation-friendly structures and pair naturally with rich visualization functions (via companion tooling) to summarize pathways, terms, and gene–set relationships.
Özellikler
- Unified ORA and GSEA workflows across multiple annotation sources
- Broad species support using up-to-date gene annotations
- Tidy outputs that integrate cleanly with downstream R data pipelines
- Built-in visualization of enrichment results through companion plotting tools
- Multi-group comparison utilities (e.g., compareCluster) for cross-condition analysis
- Detailed vignettes and manuals for reproducible, end-to-end enrichment studies
Programlama dili
R
Kategoriler
This is an application that can also be fetched from https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/. It has been hosted in OnWorks in order to be run online in an easiest way from one of our free Operative Systems.