Bu, en son sürümü NGSEPwindows_4.1.0.zip olarak indirilebilen NGSEP adlı Windows uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
NGSEP adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden herhangi bir OS OnWorks çevrimiçi öykünücüsünü başlatın, ancak daha iyi Windows çevrimiçi öykünücüsü.
- 5. Yeni başlattığınız OnWorks Windows işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin ve kurun.
- 7. Wine'ı Linux dağıtımları yazılım havuzlarınızdan indirin. Kurulduktan sonra, Wine ile çalıştırmak için uygulamaya çift tıklayabilirsiniz. Ayrıca, popüler Windows programlarını ve oyunlarını yüklemenize yardımcı olacak Wine üzerinden gösterişli bir arayüz olan PlayOnLinux'u da deneyebilirsiniz.
Wine, Windows yazılımını Linux üzerinde çalıştırmanın bir yoludur, ancak Windows gerektirmez. Wine, Windows programlarını doğrudan herhangi bir Linux masaüstünde çalıştırabilen açık kaynaklı bir Windows uyumluluk katmanıdır. Esasen Wine, Windows'a ihtiyaç duymadan tüm bu Windows uygulamalarını çalıştırabilmesi için yeterince Windows'u sıfırdan yeniden uygulamaya çalışıyor.
EKRAN GÖRÜNTÜLERİ:
NGSEP
AÇIKLAMA:
NGSEP, yüksek verimli DNA dizileme verilerinin analizi için entegre bir çerçevedir. NGSEP'in ana kullanımı, genomik varyasyonun büyük veri kümelerinin oluşturulması ve aşağı akış analizidir. NGSEP, Tek Nükleotid Varyantlarının (SNV'ler), küçük ve büyük indellerin, kısa tandem tekrarların (STR'ler), inversiyonların ve Kopya Sayısı Varyantlarının (CNV'ler) doğru tespitini ve genotiplemesini gerçekleştirir. NGSEP ayrıca işlevsel açıklama, filtreleme, format dönüştürme, karşılaştırma, kümeleme, atama, giriş analizi ve farklı türde istatistikler için modüller sağlar. İşlevlerin tam listesi wiki'mizde mevcuttur (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
HABER: Yeni genom birleştiricimizin ilk versiyonunu kullanıma sunduk. Daha fazla ayrıntıyı wiki'de bulabilirsiniz.
Özellikler
- De-novo genom derlemesi
- Ham okumaların bir referans genoma hizalanması
- SNP'ler, CNV'ler ve Yapısal Varyantların tespiti
- VCF manipülasyonu: işlevsel açıklama, birleştirme, filtreleme, karşılaştırma, format dönüştürme, atama
- Demultiplexing'i okur
- Açıklamalı genom düzeneklerinin hizalanması
- GFF3 formatındaki transkriptom açıklamalarına ilişkin istatistikler ve filtreleme
Seyirci
Sağlık Sektörü, Bilim/Araştırma, Diğer Kitle, Tarım
Kullanıcı arabirimi
Java SWT, Konsol/Terminal, Eclipse
Programlama dili
Java
Bu, https://sourceforge.net/projects/ngsep/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.