Це команда bp_multi_hmmsearch.plp, яку можна запустити у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних онлайн-робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
multi_hmmsearch - виконати hmmsearch у кількох файлах FASTA за допомогою
файл INDEX
СИНТАКСИС
multi_hmmsearch -p файл_hmm [-i] -f файл_індексу
ОПИС
Технічно це не сценарій Bio::Tools::Run, оскільки він не використовує Bioperl або Bioperl-run
компонентів, але це корисно.
обов'язкове варіанти:
-p Профіль HMM для використання для пошуку.
-f файл INDEX, який містить список файлів FASTA для кількох
пошук.
спеціальний варіанти:
-i Створити новий індексний файл із отриманими файлами hmms. Це
корисно, якщо ви хочете передати цей список як вхідні аргументи
інші програми.
-h Показати цю документацію.
ЗВ'ЯЗОК
Розсилка списки
Відгуки користувачів є невід’ємною частиною розвитку цього та інших модулів Bioperl. Надіслати
Ваші коментарі та пропозиції бажано надсилати до списку розсилки Bioperl. Ваша участь
дуже цінується.
bioperl-l@bioperl.org - Загальне обговорення
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Про списки розсилки
Звітність Помилки
Повідомляйте про помилки в систему відстеження помилок Bioperl, щоб допомогти нам відстежувати помилки та їх
резолюція. Звіти про помилки можна надсилати через Інтернет:
http://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
Використовуйте bp_multi_hmmsearch.plp онлайн за допомогою сервісів onworks.net