Це команда bp_seqcutp, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
bp_seqcut.pl
ВИКОРИСТАННЯ
bp_seqcut.pl [параметри -h,-s,-e,-f,-w] ...
bp_seqcut.pl [параметри -h,-f,-w] se ...
-h це довідкове повідомлення
-s, який залишок почати різання
-e який залишок закінчити різання
-f формат файлів, за замовчуванням FASTA, але ви можете вказати будь-що, що підтримує SeqIO від BioPerl
-w жорстка ширина обертання, це може не підтримуватися залежно від того, який формат ви використовуєте
Опис
Сценарій для вирізання послідовностей FASTA із заданим діапазоном `fastacut -s 1 -e 10 *.fasta` або
`fastacut 1-10 *.fasta`. Це лише зручна обгортка навколо модуля Bio::SeqIO.
Корисно, якщо ви хочете вирізати частину вирівнювання, щоб створити профіль певного
область послідовності.
Використовуйте bp_seqcutp онлайн за допомогою служб onworks.net