Це команда khmer, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
Кхмерські - підрахунок k-mer, фільтрація та обхід графіка FTW!
khmer — це бібліотека та інструментарій для аналізу та перетворень наборів даних на основі k-mer
СИНТАКСИС
Кхмерські [параметри] аргументи
наприклад.
Кхмерські навантаження на підрахунок -x 1e8 -k 20 reads.ct reads.fa.gz
ВИКОРИСТАННЯ
Ця довідкова сторінка лише описує Кхмерські скрипт обгортки. Щоб дізнатися про програмне забезпечення та
як ним користуватися, дивіться /usr/share/doc/khmer або інакше http://khmer.readthedocs.org/.
У Debian/Ubuntu супроводжувачі пакетів уникають безпосереднього розміщення великих колекцій скриптів
в системний PATH. Швидше, для запуску сценарію використовується один сценарій обгортки
хочу використовувати; тому, якщо в інструкціях кхмерів сказано бігти load-in-counting.py
...неважливо... вам потрібно поставити префікс до цієї команди Кхмерські. Крім того, розширення .py
може бути опущено, що призведе до команди у форматі, показаному вище.
Якщо вам це не подобається, просто додайте /usr/lib/khmer/bin до вашого особистого PATH.
Використовуйте кхмерський онлайн за допомогою служб onworks.net