Це команда xtractore, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS.
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
xtractore - витягує послідовності, що відповідають анотованим ознакам, із заданої послідовності
файл
СИНТАКСИС
xtractore [опції] особливості.gff3 послідовності.фаста
ОПИС
варіанти:
-d|--налагодження
роздрукувати вихідний результат налагодження
-h|--допомога
роздрукувати це повідомлення довідки та вийти
-i|--idfile: ФАЙЛ
файл, що містить список ідентифікаторів об’єктів (1 на рядок без пробілів); якщо надано,
будуть витягнуті лише функції з ідентифікаторами в цьому файлі
-o|--вихідний файл: ФАЙЛ
файл, до якого будуть записані вихідні послідовності; за замовчуванням термінал (стандартний вихід)
-t|--тип: STRING
тип функції для вилучення; можна використовувати кілька разів для вилучення ознак кількох
Типи
-v|--версія
роздрукувати номер версії та вийти
-V|--дослівно
друкувати докладні попередження та повідомлення про помилки
-w|--ширина: INT
ширина кожного рядка послідовності у виводі Fasta; за замовчуванням 80; встановити 0 для немає
форматування
Використовуйте xtractore онлайн за допомогою служб onworks.net