Це Linux-додаток під назвою MAF, останню версію якого можна завантажити як MAF.zip. Його можна запускати онлайн на безкоштовному хостинг-провайдері OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою MAF з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
СКРЕНИ:
MAF
ОПИС:
Нуклеотидні послідовності ДНК та РНК є повсюдним елементом усіх біологічних клітин і служать, з одного боку, всеохоплюючою бібліотекою можливостей для клітин, а з іншого боку, вражаючою регуляторною системою для контролю клітинних функцій. Представлена структура багаторівневого вирівнювання (MAF) повинна надати дослідникам просту платформу вирівнювання послідовностей як функціональний шаблон, достатньо гнучку для налаштування всіх кроків, але також достатньо комплексну, щоб об'єднати багато різних інструментів та комбінацій користувацьких параметрів, якщо необхідний або рекомендований поглиблений аналіз, наприклад, у ситуаціях з низькою швидкістю зчитування. Платформа дозволяє дослідникам застосовувати кілька вирівнювачів послідовностей та додаткові інструменти попередньої та постобробки в гнучких комбінаціях для аналізу тонких та помітних відмінностей між різними алгоритмами вирівнювання та обробки послідовностей, що застосовуються до однієї бази даних.
Процитуйте наступну публікацію: https://doi.org/10.3390/mps8030065
Функції
- Спільне застосування різних інструментів вирівнювання, прикладом якого є bash-скрипти
- Гнучкі кроки попередньої та постобробки, які можна розширювати та повністю перепроектувати
- Шаблони Bash, які економлять час розробки
Категорії
Цю програму також можна завантажити з https://sourceforge.net/projects/multialignmentframework/. Вона розміщена в OnWorks для найпростішого запуску онлайн з однієї з наших безкоштовних операційних систем.