Це програма для Windows під назвою kallisto, останню версію якої можна завантажити як kallisto_windows-v0.50.0.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою kallisto з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть будь-який онлайн емулятор ОС OnWorks з цього веб-сайту, але кращий онлайн-емулятор Windows.
- 5. З ОС OnWorks Windows, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму та встановіть її.
- 7. Завантажте Wine зі сховищ програмного забезпечення дистрибутивів Linux. Після встановлення ви можете двічі клацнути програму, щоб запустити їх за допомогою Wine. Ви також можете спробувати PlayOnLinux, модний інтерфейс замість Wine, який допоможе вам встановити популярні програми та ігри Windows.
Wine — це спосіб запуску програмного забезпечення Windows на Linux, але без використання Windows. Wine — це рівень сумісності Windows з відкритим вихідним кодом, який може запускати програми Windows безпосередньо на будь-якому робочому столі Linux. По суті, Wine намагається повторно реалізувати достатньо Windows з нуля, щоб він міг запускати всі ці програми Windows, насправді не потребуючи Windows.
СКРЕНИ:
каллісто
ОПИС:
kallisto — це програма для майже оптимальної кількісної оцінки кількості транскриптів із даних RNA-Seq, або, ширше, цільових послідовностей за допомогою високопродуктивного секвенування. Він заснований на ідеї використання псевдовирівнювання для швидкого визначення сумісності читань і цілей без необхідності вирівнювання.
Згідно з тестами, проведеними на настільному комп’ютері Mac, kallisto може кількісно оцінити 30 мільйонів людських групових зчитування RNA-seq менш ніж за 3 хвилини лише за допомогою послідовностей зчитування та індексу транскриптому, створення якого само по собі може зайняти більше 10 хвилин. А оскільки він використовує псевдовирівнювання, він стійкий до помилок у зчитуванні та зберігає ключову інформацію, необхідну для кількісної оцінки. Це робить каллісто не тільки швидким, але й високоточним. У багатьох тестах він навіть значно перевершує існуючі інструменти.
риси
- Використовує псевдовирівнювання
- Швидкий і точний
- Кількісно визначену об’ємну RNA-Seq можна проаналізувати за допомогою розшуку
- Може використовуватися з бустолами для попередньої обробки одноклітинних даних RNA-seq
Мова програмування
C
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.