Це програма Windows під назвою ShuffleFastaSeq, останню версію якої можна завантажити як ShuffleFastaSeq.exe. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та безкоштовно запустіть цю програму під назвою ShuffleFastaSeq з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть будь-який онлайн емулятор ОС OnWorks з цього веб-сайту, але кращий онлайн-емулятор Windows.
- 5. З ОС OnWorks Windows, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму та встановіть її.
- 7. Завантажте Wine зі сховищ програмного забезпечення дистрибутивів Linux. Після встановлення ви можете двічі клацнути програму, щоб запустити їх за допомогою Wine. Ви також можете спробувати PlayOnLinux, модний інтерфейс замість Wine, який допоможе вам встановити популярні програми та ігри Windows.
Wine — це спосіб запуску програмного забезпечення Windows на Linux, але без використання Windows. Wine — це рівень сумісності Windows з відкритим вихідним кодом, який може запускати програми Windows безпосередньо на будь-якому робочому столі Linux. По суті, Wine намагається повторно реалізувати достатньо Windows з нуля, щоб він міг запускати всі ці програми Windows, насправді не потребуючи Windows.
СКРЕНИ:
ShuffleFastaSeq
ОПИС:
ShuffleFastaSeq — це програма для форми Windows, написана мовою C#, для перемішування послідовностей у форматі FASTA. Випадкова перестановка отримана за допомогою простого варіанту алгоритму Фішера-Йетса, реалізованого Дурстенфельдом (https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher%E2%80%93Yates_shuffle) ( Кнут Д.Е. Мистецтво комп’ютерного програмування: напівчислові алгоритми. 3-є видання. Бостон: Аддісон-Уеслі; 1997). Вхідний файл містить одну або кілька послідовностей у форматі FASTA. Можна встановити кількість перетасувань (n) для кожної послідовності; за замовчуванням n дорівнює 100. Вихідний файл містить n перетасованих копій у форматі FASTA для кожної вхідної послідовності.
Наприклад (n=3):
Вхідний файл:
>a
ACGGT
>b
GCCCATTC
Вихідний файл:
>a
TCGAG
>a
CGAGT
>a
TGCGA
>b
CACTCCGT
>b
CCCGTATC
>b
CCTTCAGC
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Win32 (MS Windows)
Мова програмування
C#
Категорії
Це програма, яку також можна завантажити з https://sourceforge.net/projects/shufflefastaseq/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було найпростіше запускати онлайн з однієї з наших безкоштовних операційних систем.