altree-convertp - Trực tuyến trên Đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

altree-convert - Tiêu đề ...

SYNOPSIS

altree-convert [tùy chọn]

Tùy chọn:
- phiên bản chương trình chuyển đổi
--short-help | h thông báo trợ giúp ngắn gọn
--help thông báo trợ giúp với các mô tả tùy chọn
--man tài liệu đầy đủ
--first-input-file | i input file 1
--second-input-file | j input file 2 (không bắt buộc)
--output-file | o tệp đầu ra
--case-control-output | đầu ra c chứa các trường hợp / điều khiển nb
--data-type | t DNA | NUM
--phylo-prog | p PAUP | PHYLIP
--reconstruct-prog | r GIAI ĐOẠN | FAMHAP
--data-enough | q Loại dữ liệu: định tính hoặc định lượng
--nbind-ngưỡng | s Số lượng cá thể tối thiểu được yêu cầu để giữ một haplotype

LỰA CHỌN

--phiên bản
In phiên bản chương trình và thoát.

--trợ giúp ngắn
In một thông báo trợ giúp ngắn gọn và thoát.

--Cứu giúp In thông báo trợ giúp với các mô tả và lối thoát tùy chọn.

--Đàn ông In trang hướng dẫn sử dụng và thoát.

--first-input-file | i
Tệp đầu vào 1 (đầu ra của chương trình tái tạo haplotype)

--second-input-file | j
Đầu vào tệp 2 (đầu ra thứ hai của famhap hoặc tệp chứa tình trạng bệnh)

--output-file | o
Tệp đầu ra

--case-control-output | c
Tệp đầu ra chứa số trường hợp và điều khiển mang từng haplotype

--data-type | t "DNA" | "SNP"
Loại dữ liệu: DNA (ATGCU) hoặc SNP (0-1)

--phylo-prog | p "phylip" | "paup"
Chương trình tái tạo phát sinh loài

retruct-prog | r "famhap | phase"
Chương trình tái tạo Haplotype

dữ liệu-đủ điều kiện | q "định tính | định lượng"
Loại dữ liệu được phân tích

nbind-ngưỡng | s
Số lượng cá thể mang haplotype tối thiểu được yêu cầu để giữ nó cho
phân tích sâu hơn. Nếu bạn muốn giữ tất cả các haplotype, bạn phải ảnh hưởng 0 đến điều này
biến

MÔ TẢ

T chương trình sẽ đọc (các) tệp đầu vào đã cho và tạo tệp đầu vào cho
phần mềm tái tạo phát sinh loài paup hoặc phylip / paml

Sử dụng altree-convertp trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net