Đây là lệnh bp_multi_hmmsearch.plp có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
multi_hmmsearch - thực hiện tìm kiếm hmmsearch thành nhiều tệp FASTA bằng cách sử dụng
một tệp INDEX
SYNOPSIS
multi_hmmsearch -p hmm_file [-i] -f index_file
MÔ TẢ
Về mặt kỹ thuật, không phải là tập lệnh Bio :: Tools :: Run vì điều này không sử dụng bất kỳ Bioperl hoặc Bioperl-run nào
nhưng nó hữu ích.
bắt buộc Tùy chọn:
-p hồ sơ HMM để sử dụng cho việc tìm kiếm.
-f tệp INDEX chứa danh sách các tệp FASTA cho nhiều tệp
tìm kiếm.
Reduct ® Tùy chọn:
-i Tạo một tệp chỉ mục mới với các tệp hmms kết quả. Đây là
hữu ích nếu bạn muốn chuyển danh sách này làm đối số đầu vào vào
các chương trình khác.
-h Cho xem tài liệu này.
PHẢN HỒI
Mailing Chức năng
Phản hồi của người dùng là một phần không thể thiếu trong quá trình phát triển của mô-đun này và các mô-đun Bioperl khác. Gửi
các nhận xét và đề xuất của bạn tốt hơn vào danh sách gửi thư Bioperl. Sự tham gia của bạn
được nhiều đánh giá cao.
bioperl-l@bioperl.org - Thảo luận chung
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Giới thiệu về danh sách gửi thư
Báo cáo Lỗi
Báo cáo lỗi cho hệ thống theo dõi lỗi Bioperl để giúp chúng tôi theo dõi các lỗi và
nghị quyết. Báo cáo lỗi có thể được gửi qua web:
http://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
Sử dụng bp_multi_hmmsearch.plp trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net