Đây là lệnh csv2mipe có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
csv2mipe.pl - Tạo tệp MIPE dựa trên 3 tệp được phân cách bằng tab
dựa trên phiên bản MIPE v1.1
đối số: * tệp được phân cách bằng tab với dữ liệu ở cấp độ PCR
* tệp được phân cách bằng tab với dữ liệu cấp SNP
* tệp được phân cách bằng tab với dữ liệu ở cấp độ xét nghiệm
Các cột trong tệp có dữ liệu cấp độ PCR:
pcr_id
pcr_modified (có thể là bội số, chia cho dấu chấm phẩy ";")
pcr_project (có thể là nhiều, chia cho dấu chấm phẩy ";")
pcr_researcher (có thể là nhiều, chia cho dấu chấm phẩy ";")
pcr_species
nguồn_type
nguồn_id
thiết kế_seq
mồi1_oligo
mồi1_seq
mồi1_tm
mồi2_oligo
mồi2_seq
mồi2_tm
Design_remark (có thể là nhiều, chia cho dấu chấm phẩy ";")
use_seq
use_revcomp
use_remark (có thể là nhiều, chia cho dấu chấm phẩy ";")
pcr_remark (có thể là nhiều, chia cho dấu chấm phẩy ";")
Các cột trong tệp có dữ liệu cấp SNP:
pcr_id
snp_id
snp_pos
snp_amb
snp_remark (có thể là nhiều, chia cho dấu chấm phẩy ";")
Các cột trong tệp chứa dữ liệu ở cấp độ xét nghiệm:
pcr_id
snp_id
xét nghiệm_id
xét nghiệm_loại
xét nghiệm_enzym
xét nghiệm_oligo
xét nghiệm_cụ thể
xét nghiệm_đuôi
xét nghiệm_strand
xét nghiệm_remark (có thể là nhiều, chia cho dấu chấm phẩy ";")
SYNOPSIS
csv2mipe.pl
BỔ SUNG Thông TIN
Xem http://mipe.sourceforge.net
Sử dụng csv2mipe trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net