Đây là lệnh mia-2dmyocard-ica có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
mia-2dmyocard-ica - Chạy phân tích ICA trên một loạt hình ảnh 2D
SYNOPSIS
mia-2dmyocard-ica -i [tùy chọn]
MÔ TẢ
mia-2dmyocard-ica Chương trình này được sử dụng để chạy ICA trên một loạt các lần tưới máu cơ tim
hình ảnh để tạo tham chiếu tổng hợp có thể được sử dụng để sửa chuyển động bằng hình ảnh
đăng ký. Nếu mục đích là chạy bù chuyển động đầy đủ thì tốt hơn nên tạo
một bộ phân đoạn và sử dụng mia-2dmyoica-nonrigid. Nếu dữ liệu đầu vào được cung cấp bởi một
bộ phân đoạn, sau đó cũng có thể sử dụng mia-2dmyocard-icaseries. Chương trình này là
về cơ bản được sử dụng để kiểm tra các tùy chọn khác nhau về cách chạy hình ảnh tham khảo ICA
sự sáng tạo.
LỰA CHỌN
-i --in-base = (đầu vào, bắt buộc); io
tên tệp đầu vào của mẫu cắt tênXXXX.ext X = số Đối với tệp được hỗ trợ
các loại xem PLUGINS: 2dimage / io
--coefs =
xuất hệ số trộn vào tệp này
-o --out-base = (đầu ra); dây
cơ sở tên tệp đầu ra
-t --type = exr
loại tệp đầu ra
Hỗ trợ giá trị là:( @, BMP, ĐCM, EXR, JPEG, JPG, PNG, NGUYÊN,
TIF, TIFF, V, LƯỢT XEM, bmp, dcm, ví dụ: jpeg, jpg, png, thô, sốt phát ban,
khó khăn, v, vista )
-k --skip = 2
bỏ qua hình ảnh ở đầu seriesskip hình ảnh ở đầu loạt phim
-e --end = 60
hình ảnh cuối cùng trong loạt phim hình ảnh cuối cùng trong loạt phim
-C --components = 0
nr. của các thành phần, 0 = ước tính tự độngnr. trong số các thành phần, 0 = ước tính
tự động
-m --strip-mean
dải hình ảnh có ý nghĩa từ loạt phim
-f --save-features =
lưu hình ảnh tính năng
-p - theo chu kỳ
dải chỉ thành phần định kỳ
-x --max-ica-iterations = 0
Số lần lặp lại bộ giải ICA tối đa
-n --ica-bình thường hóa
ica_normalize hình ảnh tính năng
- tất cả các tính năng =
lưu tất cả hình ảnh tính năng vào
-L --LV-crop-amp = 0
Khuếch đại mặt nạ cắt LV, 0.0 = không khuếch đại mặt nạ cắt cropLV, 0.0
= không cắt
-a --a tự động-thành phần
tự động ước tính số lượng các thành phần dựa trên mối tương quan. Ngụ ý
-m và -n (Thử nghiệm)
Trợ giúp & Thông tin
-V --verbose = cảnh báo
tính chi tiết của đầu ra, in các thông báo ở cấp độ đã cho và mức độ ưu tiên cao hơn.
Các ưu tiên được hỗ trợ bắt đầu từ cấp thấp nhất là:
Thông tin - Tin nhắn cấp thấp
theo dõi - Chức năng theo dõi cuộc gọi
không - Báo cáo lỗi kiểm tra
cảnh báo - Cảnh báo
lôi - Báo cáo lỗi
gỡ lỗi - Đầu ra gỡ lỗi
tin nhắn - Tin nhắn bình thường
gây tử vong - Chỉ báo cáo các lỗi nghiêm trọng
- bản quyền
in thông tin bản quyền
-h - trợ giúp
in cái này giúp
-? --sử dụng
in một trợ giúp ngắn
--phiên bản
in số phiên bản và thoát
Chế biến
--threads = -1
Số luồng tối đa cần sử dụng để xử lý, Con số này phải thấp hơn
hoặc bằng số lõi xử lý logic trong máy. (-1:
ước tính tự động). Số luồng tối đa để sử dụng để xử lý, Điều này
số phải thấp hơn hoặc bằng số lõi bộ xử lý logic trong
máy. (-1: ước tính tự động).
BỔ SUNG: 2dimage / io
bmp Hỗ trợ đầu vào / đầu ra hình ảnh 2D BMP
Các phần mở rộng tệp được công nhận: .BMP, .bmp
Các loại phần tử được hỗ trợ:
dữ liệu nhị phân, 8 bit không dấu, 16 bit không dấu
kho dữ liệu IO ảo đến và đi từ nhóm dữ liệu nội bộ
Phần mở rộng tệp được công nhận:. @
đi đôi Io hình ảnh 2D cho DICOM
Các phần mở rộng tệp được công nhận: .DCM, .dcm
Các loại phần tử được hỗ trợ:
đã ký 16 bit, 16 bit chưa ký
exr một plugin 2dimage io cho hình ảnh OpenEXR
Các phần mở rộng tệp được công nhận: .EXR, .exr
Các loại phần tử được hỗ trợ:
32 bit không dấu, dấu phẩy động 32 bit
jpg một plugin 2dimage io cho hình ảnh jpeg xám tỷ lệ
Các phần mở rộng tệp được công nhận: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg
Các loại phần tử được hỗ trợ:
không dấu 8 bit
png một plugin 2dimage io cho hình ảnh png
Các phần mở rộng tệp được công nhận: .PNG, .png
Các loại phần tử được hỗ trợ:
dữ liệu nhị phân, 8 bit không dấu, 16 bit không dấu
nguyên Hỗ trợ đầu ra hình ảnh RAW 2D
Các phần mở rộng tệp được công nhận: .RAW, .raw
Các loại phần tử được hỗ trợ:
dữ liệu nhị phân, có dấu 8 bit, 8 bit không dấu, 16 bit có dấu, 16 bit chưa dấu,
có dấu 32 bit, không dấu 32 bit, dấu phẩy động 32 bit, dấu phẩy động 64
bit
tif Hỗ trợ đầu vào / đầu ra hình ảnh 2D TIFF
Các phần mở rộng tệp được công nhận: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff
Các loại phần tử được hỗ trợ:
dữ liệu nhị phân, 8 bit không dấu, 16 bit không dấu, 32 bit không dấu
vista một plugin 2dimage io cho hình ảnh vista
Các phần mở rộng tệp được công nhận: .V, .VISTA, .v, .vista
Các loại phần tử được hỗ trợ:
dữ liệu nhị phân, có dấu 8 bit, 8 bit không dấu, 16 bit có dấu, 16 bit chưa dấu,
có dấu 32 bit, không dấu 32 bit, dấu phẩy động 32 bit, dấu phẩy động 64
bit
THÍ DỤ
Đánh giá các tham chiếu tổng hợp từ hình ảnh imageXXXX.exr và lưu chúng vào refXXXX.exr
bằng cách sử dụng năm thành phần độc lập, nghĩa là loại bỏ, chuẩn hóa và bỏ qua 2 hình ảnh.
mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n
(Các) TÁC GIẢ
Gert Wollny
BẢN QUYỀN
Phần mềm này là Bản quyền (c) 1999‐2015 Leipzig, Đức và Madrid, Tây Ban Nha. Nó đến
với TUYỆT ĐỐI KHÔNG CÓ BẢO HÀNH và bạn có thể phân phối lại nó theo các điều khoản của GNU
GIẤY PHÉP CÔNG CỘNG CHUNG Phiên bản 3 (hoặc mới hơn). Để biết thêm thông tin, hãy chạy chương trình với
tùy chọn '--copyright'.
Sử dụng mia-2dmyocard-ica trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net