Đây là lệnh tcodee có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
tcode - Xác định vùng mã hóa protein bằng thống kê Fickett TESTCODE
SYNOPSIS
mật mã -sự nối tiếp tiếp theo -tập tin dữ liệu tập tin dữ liệu -thông tin số nguyên -bươc số nguyên -âm mưu bật lên
-outfile báo cáo -đoạn đồ thị xy
mật mã -Cứu giúp
MÔ TẢ
mật mã là một chương trình dòng lệnh từ EMBOSS (“Phần mềm Mở Sinh học Phân tử Châu Âu
Thượng hạng"). Nó là một phần của (các) nhóm lệnh "Nucleic:Tìm gen".
LỰA CHỌN
Đầu vào phần
-sự nối tiếp tiếp theo
-tập tin dữ liệu tập tin dữ liệu
Tệp dữ liệu mặc định là Etcode.dat và chứa xác suất mã hóa cho từng cơ sở.
Các xác suất dành cho cả thông tin về vị trí và thành phần. Mặc định
giá trị: Etcode.dat
Yêu cầu phần
-thông tin số nguyên
Đây là số lượng bazơ nucleotide mà thống kê TESTCODE sẽ dựa trên đó
được thực hiện mỗi lần. Sau đó, cửa sổ sẽ trượt dọc theo trình tự, bao gồm các nội dung tương tự
số căn cứ mỗi lần. Giá trị mặc định: 200
Nâng cao phần
-bươc số nguyên
Theo mặc định, cửa sổ được chọn sẽ trượt dọc theo trình tự nucleotide ba lần.
căn cứ tại một thời điểm, giữ lại khung (mặc dù thuật toán không nhạy cảm với khung).
Điều này có thể được thay đổi để tăng hoặc giảm mức tăng của slide. Giá trị mặc định:
3
Đầu ra phần
-âm mưu bật lên
Khi lựa chọn, biểu đồ của trình tự (trục X) được vẽ theo điểm mã hóa (Y
trục) sẽ được hiển thị. Trình tự phía trên đường màu xanh lá cây là mã hóa, phía dưới đường màu đỏ
dòng không mã hóa. Giá trị mặc định: N
-outfile báo cáo
-đoạn đồ thị xy
Sử dụng tcodee trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net