Đây là ứng dụng Linux có tên NeedlemanWunsch có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng Needleman_wunsch-0.3.5.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên NeedlemanWunsch này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH:
NeedlemanWunsch
SỰ MIÊU TẢ:
ĐÃ CHUYỂN ĐẾN GITHUB: https://github.com/noporpoise/seq-align
Căn chỉnh trình tự tối ưu toàn cầu bằng cách sử dụng thuật toán Needleman-Wunsch.
Căn chỉnh DNA, RNA, chuỗi protein và hơn thế nữa!
Xem liên kết cục bộ của dự án chị em của chúng tôi bằng cách sử dụng Smith-Waterman:
http://sourceforge.net/projects/smithwaterman/
Tính năng
- Hình phạt khoảng cách Affine
- Có thể đặt không có hình phạt khoảng cách cho các khoảng trống ở đầu và cuối của sự liên kết
- Màu sắc
- Đọc các tệp FASTA, FASTQ và các tệp trình tự đơn giản (bao gồm các tệp gzip'ed)
- Đặt sẵn ma trận thay thế DNA / protein (PAM / BLOSUM, v.v.)
- Có thể tải ma trận hình phạt thay thế
- Mã C di động có thể được sử dụng trong các dự án tin sinh học khác
Khán giả
Khoa học / Nghiên cứu, Giáo dục
Giao diện người dùng
Bảng điều khiển / Thiết bị đầu cuối, Dòng lệnh
Ngôn ngữ lập trình
C ++, C
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/needlemanwunsch/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.