Đây là ứng dụng Linux có tên ProGraphMSA có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống là ProGraphMSA-20130709.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên ProGraphMSA này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
ProGraphMSA
SỰ MIÊU TẢ:
ProGraphMSA là một công cụ căn chỉnh nhiều trình tự hiện đại tạo ra các mẫu khoảng trống có thể cảm nhận được về mặt phát sinh loài trong khi vẫn duy trì độ chắc chắn bằng cách cho phép các mối nối thay thế và các lỗi trong mô hình phân nhánh của cây hướng dẫn. Điều này đạt được bằng cách kết hợp biểu diễn trình tự dựa trên đồ thị như trong POA và kết hợp nó với các ưu điểm của thuật toán nhận biết phát sinh loài trong Prank. Hơn nữa, chúng tôi tính đến các biến thể trong kiểu thay thế bằng cách sử dụng tần số axit amin ước tính và bằng cách triển khai các cấu hình theo ngữ cảnh cụ thể như trong CS-Blast.Các phiên bản mới nhất của ProGraphMSA bao gồm và mở rộng cho mô hình căn chỉnh để hỗ trợ chèn và xóa đơn vị lặp lại song song.
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/prographmsa/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.