This is the Linux app named pydna whose latest release can be downloaded as HackathonDTUsourcecode.tar.gz. It can be run online in the free hosting provider OnWorks for workstations.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên pydna với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH:
con trăn
SỰ MIÊU TẢ:
Sao chép bằng Python! Cấu trúc dữ liệu cho DNA sợi đôi & mô phỏng tái tổ hợp tương đồng, lắp ráp Gibson, cắt & dán nhân bản. Việc lập kế hoạch các cấu trúc di truyền với nhiều phần và các bước lắp ráp, chẳng hạn như các con đường trao đổi chất tái tổ hợp, thường khó ghi chép đúng cách như bằng chứng từ tình trạng tài liệu kém trong các tài liệu khoa học. Gói pydna python cung cấp mô tả chính thức có thể đọc được bằng con người về các chiến lược lắp ráp và nhân bản di truyền trong Python cho phép mô phỏng và xác minh. Pydna có thể được sử dụng làm tài liệu thực thi để nhân bản.
Tính năng
- Tiêu hóa hạn chế
- Điện di gel DNA với việc tạo ra hình ảnh gel
- Sự tái kết hợp đồng nhất
- lắp ráp Gibson
- Lắp ráp cổng vàng (đang tiến hành)
- Thiết kế mồi và PCR
Ngôn ngữ lập trình
Python
Danh Mục
Đây là ứng dụng cũng có thể được tải xuống từ https://sourceforge.net/projects/pydna.mirror/. Ứng dụng này được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến theo cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ điều hành miễn phí của chúng tôi.