Đây là ứng dụng Linux có tên QUASR có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống là QUASR_v6.08.tar. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên QUASR này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH:
QUASR
SỰ MIÊU TẢ:
QUASR là một đường dẫn nhẹ được viết để xử lý và phân tích dữ liệu giải trình tự (NGS) thế hệ tiếp theo từ các nền tảng Illumina, 454 và Ion Torrent. Mặc dù ban đầu được viết cho dữ liệu virus, nó đủ chung để hoạt động trên bất kỳ tập dữ liệu NGS nào. Các chức năng bao gồm:
loại bỏ trùng lặp
phân kênh
loại bỏ lớp sơn lót
vẽ đồ thị đảm bảo chất lượng (QA)
kiểm soát chất lượng (QC)
tạo sự đồng thuận
xác định biến thể thiểu số
vẽ đồ thị biến thể thiểu số
Phiên bản hiện tại chính là 6.X, được viết bằng Python3. 7.X là bản viết lại của tôi bằng Java, nhưng vẫn đang được tiến hành. Cả hai đều được viết là nhẹ nhất có thể để chúng có thể chạy với yêu cầu bộ nhớ tối thiểu trên máy tính để bàn hoặc máy tính xách tay cũng như trên một cụm máy tính.
Nếu bạn có bất kỳ vấn đề nào với QUASR, vui lòng liên hệ với tôi theo địa chỉ email được cung cấp trong README.
Khán giả
Nghiên cứu khoa học
Giao diện người dùng
Dòng lệnh
Ngôn ngữ lập trình
Python
Categories
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/quasr/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.