Đây là ứng dụng Windows có tên NGSEP có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng NGSEPwindows_4.1.0.zip. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên NGSEP này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động bất kỳ trình giả lập trực tuyến OS OnWorks nào từ trang web này, nhưng trình giả lập trực tuyến Windows tốt hơn.
- 5. Từ Hệ điều hành Windows OnWorks bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng và cài đặt nó.
- 7. Tải xuống Wine từ kho phần mềm phân phối Linux của bạn. Sau khi cài đặt, bạn có thể nhấp đúp vào ứng dụng để chạy chúng với Wine. Bạn cũng có thể thử PlayOnLinux, một giao diện đẹp mắt trên Wine sẽ giúp bạn cài đặt các chương trình và trò chơi phổ biến của Windows.
Wine là một cách để chạy phần mềm Windows trên Linux, nhưng không cần Windows. Wine là một lớp tương thích Windows mã nguồn mở có thể chạy các chương trình Windows trực tiếp trên bất kỳ máy tính để bàn Linux nào. Về cơ bản, Wine đang cố gắng triển khai lại đủ Windows từ đầu để nó có thể chạy tất cả các ứng dụng Windows đó mà không thực sự cần đến Windows.
MÀN HÌNH:
NGSEP
SỰ MIÊU TẢ:
NGSEP là một khung tích hợp để phân tích dữ liệu giải trình tự thông lượng cao DNA. Công dụng chính của NGSEP là xây dựng và phân tích hạ nguồn các bộ dữ liệu lớn về sự biến đổi của hệ gen. NGSEP thực hiện phát hiện chính xác và định dạng kiểu gen của các Biến thể Nucleotide Đơn (SNV), các indels nhỏ và lớn, các lần lặp lại song song ngắn (STR), các phép đảo ngược và Các Biến thể Số Sao chép (CNV). NGSEP cũng cung cấp các mô-đun để chú thích chức năng, lọc, chuyển đổi định dạng, so sánh, phân cụm, nhập, phân tích nội dung và các loại thống kê khác nhau. Danh sách đầy đủ các chức năng có sẵn trong wiki của chúng tôi (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
TIN TỨC: Chúng tôi vừa cung cấp phiên bản đầu tiên của trình lắp ráp bộ gen de-novo của chúng tôi. Thông tin chi tiết có sẵn trong wiki.
Tính năng
- Lắp ráp bộ gen De-novo
- Căn chỉnh các lần đọc thô với một bộ gen tham chiếu
- Phát hiện SNP, CNV và các biến thể cấu trúc
- Thao tác VCF: chú thích chức năng, hợp nhất, lọc, so sánh, chuyển đổi định dạng, áp đặt
- Đọc phân kênh
- Sự sắp xếp của các cụm bộ gen được chú thích
- Thống kê và lọc các niên giám trong bảng điểm ở định dạng GFF3
Khán giả
Ngành chăm sóc sức khỏe, Khoa học / Nghiên cứu, Đối tượng khác, Nông nghiệp
Giao diện người dùng
Java SWT, Bảng điều khiển / Thiết bị đầu cuối, Eclipse
Ngôn ngữ lập trình
Java
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/ngsep/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.