这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令 dane，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
dan - 计算核酸解链温度
概要
担 -序列 后继 -窗口大小 整数 -移位增量 整数 -dnaconc 浮动
-盐浓缩 浮动 [-产品 切换] -甲酰胺 浮动 -不匹配 浮动 -产品 整数
[-热 切换] -温度 浮动 -核糖核酸 布尔 -阴谋 切换 -mintemp 浮动
-图形 xy图 -输出文件 报告
担 -救命
商品描述
担 是来自 EMBOSS（“欧洲分子生物学开放软件
套房”）。 它是“Nucleic:Properties,Nucleic:Composition”命令组的一部分。
配置
输入 部分
-序列 后继
其他要求 部分
-窗口大小 整数
序列的熔点和其他热力学性质的值是
通过采用称为窗口的短序列长度并确定
该窗口中序列的属性。 窗口沿着
在每个新位置计算属性的序列。 默认值：20
-移位增量 整数
这是窗口在每次增量时移动的量，以便找到
沿着序列的熔点和其他特性。 默认值：1
-dnaconc 浮动
默认值：50。
-盐浓缩 浮动
默认值：50。
额外 部分
产品 选项
-产品 切换
这会提示甲酰胺百分比、允许的错配百分比和产品长度。
-甲酰胺 浮动
这指定了计算中使用的甲酰胺百分比（除非
- 使用产品）。 默认值：0。
-不匹配 浮动
这指定了要在计算中使用的百分比不匹配（它被忽略，除非
- 使用产品）。 默认值：0。
-产品 整数
这指定了要在计算中使用的产品长度（除非
- 使用产品）。 默认值：$(windowsize)
热力学 选项
-热 切换
将序列窗口的 DeltaG、DeltaH 和 DeltaS 值输出到输出数据
文件中。
-温度 浮动
如果 -thermo 已被指定，那么这指定了温度
计算 DeltaG、DeltaH 和 DeltaS 值。 默认值：25。
高级 部分
-核糖核酸 布尔
这指定该序列是 RNA 序列而不是 DNA 序列。
输出 部分
-阴谋 切换
如果未指定，则生成输出数据文件，否则生成
沿着序列产生熔点。
-mintemp 浮动
输入图温标（y 轴）的最小值。 默认值：
55.
-图形 xy图
-输出文件 报告
如果未生成绘图，则每个窗口中的熔点等数据
沿着序列输出到文件。
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