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kmc_tools-complex - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 kmc_tools-complex

这是 kmc_tools-complex 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


kmc_tools-complex - 具有多个输入数据库的复杂操作

概要


kmc_tools 复杂

商品描述


此命令执行由定义的操作组合
. 它是具有以下语法的文本文件:

__________________________________________________________________
|输入: |
| = [参数] |
| = [参数] |
|... |
| = [参数] |
|输出:|
| = [ [...] |
|[输出参数:__|
| ] | /
| | /
|_________________________________________________________________________|/

有无库存


输入1, 输入2, ..., 输入N
用于定义方程的输入名称

输入1_数据库路径, 输入2_数据库路径, ..., 输入N_db_path
k-mers 集的路径

对于每个输入,都有可以设置的附加参数:

-ci
排除 k-mers 发生少于次

cx
排除 k-mers 出现的次数超过次

输出数据库路径
输出数据库的路径

参考输入
input1, input2, ..., inputN 之一

歌剧
{*,-,~,+} 之一,指的是 {intersect, kmers_subtract, counters_subtract,
联盟}

运算符“*”具有最高优先级。 其他运营商具有相同的优先级。 的顺序
可以用括号更改操作。

输出参数:

-ci
排除 k-mers 发生少于次

-cx
排除 k-mers 出现的次数超过次

-CS
计数器的最大值


__________________________________________________________________
|输入: |
|set1 = kmc_o1 -ci5 |
|set2 = kmc_o2 |
|set3 = kmc_o3 -ci10 -cx100 __|
|输出:| /
|结果 = (set3+set1)*set2 | /
|_________________________________________________________________________|/

使用 onworks.net 服务在线使用 kmc_tools-complex


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Linux 命令

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