这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令重复程序，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
repeatoire - mauveAligner 包的一部分
商品描述
允许 opţiuni:
--允许冗余 参数 (=1)
允许冗余对齐？
- 链 参数 (=1)
连锁种子？
- 延长 参数 (=1)
在链条上执行间隙延伸？
- 窗户 参数 (=-1)
间隙扩展期间使用的窗口大小
--gapopen 参数 (=0)
空位罚球
--间隙扩展 参数 (=0)
间隙延长罚分
- H 参数 (=0.00800000038)
过渡到同源
- 帮帮我 获取帮助信息
- 最高 arg (=procrast.highest) 包含最高得分对齐的文件
对于每个多重性
--l 参数 (=1)
最小重复长度
--大重复 参数 (=0)
优化大重复
--加载-sml 参数 (=0)
尝试加载现有的 SML 文件？
--onlydirect 参数 (=0)
只处理同一条链上的种子匹配？
--仅扩展 参数 (=0)
只输出扩展匹配？
- 输出 ARG
procastAligner 输出
--百分比 参数 (=0)
最小重复家庭 % id
--小说子集 参数 (=0)
找到新的子集匹配？
--小说匹配 参数 (=1)
使用在间隙扩展期间发现的新匹配？
--rmax 参数 (=500)
最大重复多重性（最大拷贝数）
--rmin 参数 (=2)
最小重复多重性（最小拷贝数）
--种子 ARG
种子输出文件
- 序列 ARG
FastA序列文件
--小重复 参数 (=0)
优化小重复
--计分 ARG
输出具有相应的分数和对齐信息
- 固体 参数 (=0)
使用固体/精确种子？
--sp 参数 (=0)
最小总和对齐分数
--串联 参数 (=1)
允许串联重复？
--两次命中 参数 (=0)
需要在 w 内击中两次才能触发间隙延伸？
--你 参数 (=0.00100000005)
过渡到无关
--不对齐 参数 (=1)
取消对齐非同源序列？
--w 参数 (=0)
最大间隙宽度
--xmfa ARG
XMFA 格式输出
--xml ARG
XML 格式输出
--z 参数 (=0)
种子重量
使用 onworks.net 服务在线重复使用
