这是名为 BioEmu 的 Linux 应用程序,其最新版本可下载为 0.1.12sourcecode.tar.gz。它可在免费的工作站托管服务提供商 OnWorks 上在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行此名为 BioEmu 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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生物Emu
商品描述
生物分子模拟器(简称 BioEmu)是一个模型,它根据给定的氨基酸序列,从蛋白质单体结构的近似平衡分布中进行采样。默认情况下,非物理结构(空间冲突或链不连续)将被过滤掉,因此您通常得到的输出样本量会比要求的少。如果您的蛋白质包含较大的无序区域,而这些区域很可能产生空间冲突,则差异可能会非常大。BioEmu 以骨架框架表示形式输出结构。为了重建侧链,可以使用多种工具。例如,我们与 HPacker 接口进行侧链重建,并提供运行简短分子动力学 (MD) 平衡分析的基本工具。
功能
- 侧链重构和MD松弛
- 第三方代码
- Azure 人工智能铸造厂
- 复现预印本的结果
- 采样结构
- BioEmu 是 Linux 独有的 pip 安装包
程式语言
Python
分类
此应用程序也可从 https://sourceforge.net/projects/bioemu.mirror/ 获取。它已托管在 OnWorks 中,以便通过我们的免费操作系统之一以最便捷的方式在线运行。
