这是名为 CSBB-v3.0 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 CSBB-v3.0.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 CSBB-v3.0 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
CSBB-v3.0
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商品描述
CSBB 是一个基于命令行的生物信息学套件,用于分析通过各种生物实验途径获得的生物数据。 CSBB 是在 Perl 中实现的,同时它还利用了 R、java、python 和 ruby 在后台的特定模块的使用。 CSBB 的主要重点是让生物学和生物信息学社区的用户通过执行下游分析任务而受益,同时无需编写编程代码。 CSBB 目前可在 Linux、UNIX 上使用。目前,CSBB 提供了 18 个模块,专注于分析任务,例如执行上分位数归一化、交互式可视化和下一代测序管道。 CSBB 现在还具有处理公共数据的能力。 为用户提供端到端的管道体验。
功能
- RNA序列
- 芯片序列
- ATAC序列
- 正常化
- 差异表达
- 公共数据处理
- 端到端管道
- 开源
- 可视化
- 生物信息学
目的
学术/科研
程式语言
Perl的
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/csbb-v3-0/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。