适用于 Linux 的 ForceGen 下载

这是名为 ForceGen 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 ForceGenV0.4.jar。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。

 
 

使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 ForceGen 的应用程序。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序,安装并运行。

截图:


原力发电机


描述:

请引用:

ForceGen:Gromacs 的原子共价键常数推导。 Nash A、Collier T、Birch HL、de Leeuw NH。 分子建模杂志 (2018), (24)5。 DOI:10.1007/s00894-017-3530-6

教学视频:
https://youtu.be/fQVXv8Ge_tg

这个 Java 可执行 jar 从量子力学高斯计算中导出用于键拉伸和键角的二阶键力常数。 这些计算与 Amber 力场族或从分子碎片的 Hessian 的二阶张量导出的任何力场兼容。 输出已与 Gromacs 拓扑格式兼容。

使用的例子包括推导键力常数和平衡值:
- 蛋白质活性位点中的键合金属
-修饰的氨基酸
-小分子/药物分子

可以通过“浏览所有文件”链接找到示例文件的 zip。

由 Anthony Nash 博士(牛津)撰写
得到 Thomas Collier 博士、Helen Birch 教授和

特征

  • 键合拉伸力常数推导
  • 键角力常数推导
  • 与 Gromacs 拓扑的兼容性


这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/forcegen/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。



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