这是名为 misc 基因组学工具的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 misc_genomics_tools_v0.2.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 misc 基因组学工具的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
Ad
杂项基因组学工具
商品描述
这是在基因组学项目过程中开发的各种程序的集合,涉及假单胞菌菌株 NCIMB10586
这些包括
* 使用 illumina 读数识别和纠正(例如)pacbio 基因组序列中的错误
* 原核序列/基因组注释
* RNAseq 分析 - 将多个样本作为一个组进行归一化和整理
* RNAseq 可视化
所有脚本都是在“尽力而为”的基础上提供的,但是由于各种系统更改,我不保证所有文件都是分析中使用的版本。
另外,请注意,这些都是出于权宜之计而开发的——也就是说,该过程预计将以最终形式执行一次; 很少注意优化运行时或将脚本链接在一起,有时需要手动访问外部资源。
功能
- 基因组序列纠错
- 原核序列注释
- 将多个样本作为一组进行 RNAseq 标准化
- RNAseq 样本系列/时间进程可视化
目的
学术/科研
程式语言
Perl的
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便通过我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。