这是名为 NGSReadsTreatment 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 NgsReadsTreatmentGI_v1.2.jar 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并使用 OnWorks 在线运行名为 NGSReadsTreatment 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
NGS读取处理
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商品描述
NGSReadsTreatment,一种计算工具,用于删除双端或单端数据集中的重复读取。 NGSReadsTreatment 可以处理来自任何平台的具有相同或不同序列长度的读取。使用概率结构布谷鸟过滤器,通过将读数与其自身进行比较来识别和删除冗余读数。因此,除了读取集之外不需要任何先决条件。在分析不同的读取集时,NGSReadsTreatment 与其他冗余去除工具进行了比较。结果表明,NGSReadsTreatment 在删除冗余量和执行所有分析的计算内存使用方面均优于其他工具。注意:要运行新版本,请使用 Java 版本 11。
该应用程序也可以从 https://sourceforge.net/projects/ngsreadstreatment/ 获取。它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。