这是名为 SeqSelector 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 SeqSelector1.1b.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 SeqSelector 和 OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
序列选择器
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商品描述
SeqSelector 工具集是一套用户友好的、独立于平台的 Python 脚本,用于通过基于杂交的序列捕获来促进选择序列,从而有针对性地富集下一代文库。 这些脚本不需要编程知识,可以应用于模型或非模型物种的基因组序列。 我们建议一个工作流程,其中首先从以前的研究和功能基因注释的公开可用数据集中识别感兴趣的基因。 一旦确定了候选基因列表,就会从参考基因组中选择它们的序列。 这些序列在对非模型物种的未注释基因组进行 BLAST 搜索时用作查询,然后返回相应的序列,可用于设计用于基于杂交的序列捕获的诱饵。
程式语言
Python
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/seqselector/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。